Se me ocurre que lo que puede haber pasado es que no haya ejecutado correctamente el cofigurar.sh y eso haya hecho que no se modifiquen los valores del archivo .properties y en ese archivo haya datos de una instalación Windows.
Hace lo siguiente: Ejecuta el configurar.sh desde una tareminal y guardáte todos los mensajes que da. Luego volve a intentar levantar el servidor. Si sigue fallando, postea el log completo que te dio el configurar.sh
Saludos
Antonio
