Luego deberias subir el archivo .jasper en la ventana reportes jasper en el perfil de configuracion de la compania, reemplazando el original.
El archivo .java no sirve para nada, solo te sirve el .jrxml para editar y crear reportes, cuando lo compilas te genera el .jasper, ese tenes que subir.
Asegurate se tener un backup del original antes de reemplazarlo
Saludos
