El plan de cuentas y en consecuencia su moneda son únicos en el sistema. No podes tener N planes de cuentas, porque cada documento va a asentarse con las cuentas de un único plan. No es posible llevar N contabilidades paralela cuya única diferencia sea la moneda del plan de cuenta. Es decir, vas a tener que trabajar con un plan en dólares o en moneda nacional.
PD: Si bien Libertya tiene una sección dentro de la configuración de Compañía para indicar un segundo esquema contable… esto es algo que no esta probado y no recomandamos su uso. Si queres podes investigar y hacer pruebas por ese camino pero probablemente se trate de funcionalidad parcialmente activada.
