Buenas Daniel,
Si modificaste archivos java del core de libertya desde los fuentes de github, entonces podes compilar el proyecto completo mediante utils_dev/compilar.sh. Tené en cuenta que esto te genera un nuevo ServidorOXP.zip y además pisará tu actual /ServidorOXP con los nuevos binarios.
Si por el contrario desarrollaste un componente ad-hoc siguiendo los lineamientos de libertya components, entonces deberás empaquetar los binarios dentro de un jar, ubicarlos en /ServidorOXP/lib/plugins y ejecutar ConfigurarAuto.sh para que embeba los cambios.
Saludos!