Milton,
La manera mas simple es poner a las entidades comerciales en diferentes organizaciones y limitar el acceso por ORG.
Otra manera es customizar el BeforeSAve de los comprobantes en cuestion y agregar lógica para asociar los grupos de entidades comerciales a los perfiles/usuarios, pero eso requiere agregar también alguna tablay codificar.
Saludos
Antonio.
