[Best S.A.]

Hola, una opción seria que hicieras un remito de entrada solamente, sin cargar la factura asociada para evitar que te impacte en lo contable, y luego sacar esa mercadería por inventario físico, el problema de este es que te queda un remito de entrada en el sistema que no existe en la realidad, pero es una posibilidad.
Saludos.