Buen día, para asociar un formato de impresión, en este caso de tipo jasper, deberías crear un Informe y Proceso que apunte a ese JasperReport. Luego, desde la ventana Tipo de Documento, deberías asociar ese proceso al documento.
De esta forma se logra que cada tipo de documento puede tener su propia impresión.
Saludos
Matías
