Buenas,
En realidad el patch simplemente modifica la lógica funcional alojada en los archivos binarios de Libertya, pero no realiza cambio alguno a nivel base de datos. Sólo en este último caso es necesario ejecutar el Instalador de Componentes, el cual presenta en pantalla el mensaje al que hacés mención.
Si seguiste los pasos indicados, ya deberías tener aplicado el patch.
Saludos,
Federico
