Hola,
le dí una mirada rápida al código del proceso que genera el archivo entrada.txt y por lo que ví no separa los impuestos registrados en una factura, los agrupa todos como IVA.
Para el caso de percepciones, deben enviarse dentro del tag “ImpTrib” en el request, por lo que deberían venir separadas del IVA.
Las especificaciones técnicas del webservice de AFIP están acá, dentro de “Herramientas de asistencia”, vas a encontrar el manual para el desarrollador.
Saludos,
Juan Manuel
