La factura es un reporte jasper. Imagino que la comanda lo hiciste Jasper. Por lo tanto para que te imprima esta “factura” deberías cambiar el jasper ingresando como System o como Configuración del sistema y dentro de impresión y luego Jasper Report, buscar la factura y cambiarla.
Lo que no me cierras es que dices que la comanda es para operaciones de movimientos. Esto debería estar relacionado con remitos y no con facturas (a lo mejor me equivoco y no estoy entendiendo el diseño, quizás muy poca información).